Các cơ quan, đoàn thể thuộc UBND thành phố quản lý bao gồm:

A. Các cơ quan chuyên môn thuộc UBND thành phố:
- BQL các khu công nghiệp và chế xuất
- Sở Công thương
- Sở Giáo dục và đào tạo
- Sở Giao thông vận tải
- Sở Kế hoạch và Đầu tư
- Sở Khoa học và Công nghệ
- Sở Lao động - Thương binh và Xã hội
- Sở Ngoại vụ
- Sở Nội vụ
- Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn
- Sở Tài chính
- Sở Tài nguyên và Môi trường
- Sở Thông tin và Truyền thông
- Sở Tư pháp
- Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch
- Sở Xây dựng
- Sở Y tế
- Thanh tra
- Văn phòng Đoàn ĐBQH và HĐND thành phố
- Văn phòng UBND thành phố
- Ban Quản lý đầu tư xây dựng Khu công nghệ cao theo phê duyệt của Thủ tướng chính phủ.
 
B. Đơn vị sự nghiệp thuộc UBND thành phố:
- Đài Phát thanh và Truyền hình
- Trung tâm Xúc tiến đầu tư
- Trường Cao đẳng nghề Đà Nẵng
- Quỹ Đầu tư phát triển Đà Nẵng
- Viện nghiên cứu PT KT-XH Đà Nẵng
- Trung tâm Phát triển nguồn nhân lực chất lượng cao thành phố Đà Nẵng.
 
C. Doanh nghiệp do nhà nước làm chủ sở hữu thuộc UBND thành phố:
- Công ty TNHH một thành viên Thương mại QN – ĐN
- Công ty TNHH một thành viên QL và KT CT thủy lợi
- Công ty TNHH một thành viên Xổ số KT và dịch vụ in
- Công ty TNHH 2 TV Thẩm định giá và dịch vụ tài chính
- Công ty TNHH một thành viên Môi trường đô thị
- Công ty TNHH một thành viên XD và phát triển hạ tầng ĐN
- Công ty TNHH một thành viên Vật liệu XD-XL và KD nhà
- Công ty TNHH một thành viên Cấp nước
- Công ty TNHH một thành viên Nhà xuất bản tổng hợp
 
D. Chính quyền cơ sở:
- UBND quận Hải Châu
- UBND quận Thanh Khê
- UBND quận Ngũ Hành Sơn
- UBND quận Sơn Trà
- UBND quận Liên Chiểu
- UBND quận Cẩm Lệ
- UBND huyện Hòa Vang
- UBND huyện Hoàng Sa.
 
E. Các Hội cấp thành phố: 111 hội
 
F. Các quỹ xã hội, từ thiện cấp thành phố: 12 quỹ
 
Theo tiến độ xây dựng, đến cuối tháng 10-2013, công trình Trung tâm Hành chính TP Đà Nẵng sẽ được đưa vào sử dụng. Theo đó, các sở, ban, ngành của thành phố Đà Nẵng sẽ tập trung hoạt động tại tòa nhà. Một số ít đơn vị thành viên của các sở, ngành hoạt động có tính đặc thù được bố trí hoạt động tập trung tại khu vực quy hoạch phía bắc Công viên Thanh Niên.